Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NINJ2Q9NZG7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NINJ2Q9NZG7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NINJ2Q9NZG7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NINJ2Q9NZG7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NINJ2Q9NZG7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NINJ2Q9NZG7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NINJ2Q9NZG7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NINJ2Q9NZG7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NINJ2Q9NZG7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NINJ2Q9NZG7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NINJ2Q9NZG7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NINJ2Q9NZG7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NINJ2Q9NZG7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NINJ2Q9NZG7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NINJ2Q9NZG7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINJ2Q9NZG7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NINJ2Q9NZG7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NINJ2Q9NZG7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NINJ2Q9NZG7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NINJ2Q9NZG7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NINJ2Q9NZG7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NINJ2Q9NZG7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NINJ2Q9NZG7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NINJ2Q9NZG7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NINJ2Q9NZG7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NINJ2Q9NZG7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NINJ2Q9NZG7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NINJ2Q9NZG7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NINJ2Q9NZG7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NINJ2Q9NZG7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NINJ2Q9NZG7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NINJ2Q9NZG7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NINJ2Q9NZG7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NINJ2Q9NZG7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NINJ2Q9NZG7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NINJ2Q9NZG7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NINJ2Q9NZG7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NINJ2Q9NZG7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NINJ2Q9NZG7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NINJ2Q9NZG7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NINJ2Q9NZG7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NINJ2Q9NZG7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NINJ2Q9NZG7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NINJ2Q9NZG7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NINJ2Q9NZG7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NINJ2Q9NZG7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NINJ2Q9NZG7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NINJ2Q9NZG7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NINJ2Q9NZG7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NINJ2Q9NZG7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NINJ2Q9NZG7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NINJ2Q9NZG7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NINJ2Q9NZG7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NINJ2Q9NZG7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NINJ2Q9NZG7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NINJ2Q9NZG7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NINJ2Q9NZG7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NINJ2Q9NZG7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NINJ2Q9NZG7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NINJ2Q9NZG7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NINJ2Q9NZG7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NINJ2Q9NZG7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NINJ2Q9NZG7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NINJ2Q9NZG7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NINJ2Q9NZG7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NINJ2Q9NZG7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NINJ2Q9NZG7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NINJ2Q9NZG7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NINJ2Q9NZG7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NINJ2Q9NZG7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NINJ2Q9NZG7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms