Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRN3Q9NYV6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRN3Q9NYV6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RRN3Q9NYV6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRN3Q9NYV6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRN3Q9NYV6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRN3Q9NYV6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRN3Q9NYV6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRN3Q9NYV6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRN3Q9NYV6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRN3Q9NYV6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRN3Q9NYV6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRN3Q9NYV6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRN3Q9NYV6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRN3Q9NYV6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRN3Q9NYV6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRN3Q9NYV6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRN3Q9NYV6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRN3Q9NYV6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRN3Q9NYV6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRN3Q9NYV6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRN3Q9NYV6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRN3Q9NYV6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRN3Q9NYV6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRN3Q9NYV6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRN3Q9NYV6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRN3Q9NYV6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRN3Q9NYV6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRN3Q9NYV6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RRN3Q9NYV6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRN3Q9NYV6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRN3Q9NYV6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRN3Q9NYV6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRN3Q9NYV6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRN3Q9NYV6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRN3Q9NYV6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRN3Q9NYV6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRN3Q9NYV6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRN3Q9NYV6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRN3Q9NYV6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRN3Q9NYV6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRN3Q9NYV6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRN3Q9NYV6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRN3Q9NYV6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRN3Q9NYV6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRN3Q9NYV6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRN3Q9NYV6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRN3Q9NYV6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRN3Q9NYV6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RRN3Q9NYV6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRN3Q9NYV6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRN3Q9NYV6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRN3Q9NYV6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRN3Q9NYV6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RRN3Q9NYV6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRN3Q9NYV6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RRN3Q9NYV6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRN3Q9NYV6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRN3Q9NYV6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRN3Q9NYV6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRN3Q9NYV6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRN3Q9NYV6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRN3Q9NYV6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRN3Q9NYV6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms