Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLCO1C1Q9NYB5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLCO1C1Q9NYB5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLCO1C1Q9NYB5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO1C1Q9NYB5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO1C1Q9NYB5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO1C1Q9NYB5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLCO1C1Q9NYB5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO1C1Q9NYB5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO1C1Q9NYB5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO1C1Q9NYB5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO1C1Q9NYB5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO1C1Q9NYB5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO1C1Q9NYB5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO1C1Q9NYB5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLCO1C1Q9NYB5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLCO1C1Q9NYB5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLCO1C1Q9NYB5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO1C1Q9NYB5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLCO1C1Q9NYB5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLCO1C1Q9NYB5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLCO1C1Q9NYB5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLCO1C1Q9NYB5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLCO1C1Q9NYB5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO1C1Q9NYB5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO1C1Q9NYB5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLCO1C1Q9NYB5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLCO1C1Q9NYB5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLCO1C1Q9NYB5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO1C1Q9NYB5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLCO1C1Q9NYB5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLCO1C1Q9NYB5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO1C1Q9NYB5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO1C1Q9NYB5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO1C1Q9NYB5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO1C1Q9NYB5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLCO1C1Q9NYB5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLCO1C1Q9NYB5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLCO1C1Q9NYB5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLCO1C1Q9NYB5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO1C1Q9NYB5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO1C1Q9NYB5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO1C1Q9NYB5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO1C1Q9NYB5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO1C1Q9NYB5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO1C1Q9NYB5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO1C1Q9NYB5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLCO1C1Q9NYB5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLCO1C1Q9NYB5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLCO1C1Q9NYB5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLCO1C1Q9NYB5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLCO1C1Q9NYB5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLCO1C1Q9NYB5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLCO1C1Q9NYB5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLCO1C1Q9NYB5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLCO1C1Q9NYB5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLCO1C1Q9NYB5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLCO1C1Q9NYB5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLCO1C1Q9NYB5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLCO1C1Q9NYB5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLCO1C1Q9NYB5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLCO1C1Q9NYB5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLCO1C1Q9NYB5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLCO1C1Q9NYB5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLCO1C1Q9NYB5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLCO1C1Q9NYB5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLCO1C1Q9NYB5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms