Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCF3Q9NUQ8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCF3Q9NUQ8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCF3Q9NUQ8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCF3Q9NUQ8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCF3Q9NUQ8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCF3Q9NUQ8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCF3Q9NUQ8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCF3Q9NUQ8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCF3Q9NUQ8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCF3Q9NUQ8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCF3Q9NUQ8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCF3Q9NUQ8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCF3Q9NUQ8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCF3Q9NUQ8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCF3Q9NUQ8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCF3Q9NUQ8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCF3Q9NUQ8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCF3Q9NUQ8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCF3Q9NUQ8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCF3Q9NUQ8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCF3Q9NUQ8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCF3Q9NUQ8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCF3Q9NUQ8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCF3Q9NUQ8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCF3Q9NUQ8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCF3Q9NUQ8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCF3Q9NUQ8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCF3Q9NUQ8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCF3Q9NUQ8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCF3Q9NUQ8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCF3Q9NUQ8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCF3Q9NUQ8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCF3Q9NUQ8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCF3Q9NUQ8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCF3Q9NUQ8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCF3Q9NUQ8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCF3Q9NUQ8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCF3Q9NUQ8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCF3Q9NUQ8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCF3Q9NUQ8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCF3Q9NUQ8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCF3Q9NUQ8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCF3Q9NUQ8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCF3Q9NUQ8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCF3Q9NUQ8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCF3Q9NUQ8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCF3Q9NUQ8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCF3Q9NUQ8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCF3Q9NUQ8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCF3Q9NUQ8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCF3Q9NUQ8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCF3Q9NUQ8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCF3Q9NUQ8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCF3Q9NUQ8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCF3Q9NUQ8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCF3Q9NUQ8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCF3Q9NUQ8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCF3Q9NUQ8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCF3Q9NUQ8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCF3Q9NUQ8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCF3Q9NUQ8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCF3Q9NUQ8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCF3Q9NUQ8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCF3Q9NUQ8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCF3Q9NUQ8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCF3Q9NUQ8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCF3Q9NUQ8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCF3Q9NUQ8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCF3Q9NUQ8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCF3Q9NUQ8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCF3Q9NUQ8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCF3Q9NUQ8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCF3Q9NUQ8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms