Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FOXD4L1Q9NU39 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FOXD4L1Q9NU39 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXD4L1Q9NU39 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
FOXD4L1Q9NU39 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
FOXD4L1Q9NU39 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
FOXD4L1Q9NU39 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
FOXD4L1Q9NU39 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
FOXD4L1Q9NU39 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOXD4L1Q9NU39 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FOXD4L1Q9NU39 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD4L1Q9NU39 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FOXD4L1Q9NU39 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms