Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3GQ9NS98 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA3GQ9NS98 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3GQ9NS98 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3GQ9NS98 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3GQ9NS98 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA3GQ9NS98 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3GQ9NS98 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3GQ9NS98 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3GQ9NS98 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3GQ9NS98 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3GQ9NS98 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3GQ9NS98 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3GQ9NS98 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3GQ9NS98 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3GQ9NS98 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3GQ9NS98 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3GQ9NS98 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3GQ9NS98 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3GQ9NS98 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEMA3GQ9NS98 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3GQ9NS98 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3GQ9NS98 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3GQ9NS98 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3GQ9NS98 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3GQ9NS98 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3GQ9NS98 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3GQ9NS98 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3GQ9NS98 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3GQ9NS98 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3GQ9NS98 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3GQ9NS98 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3GQ9NS98 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3GQ9NS98 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA3GQ9NS98 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA3GQ9NS98 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3GQ9NS98 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3GQ9NS98 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3GQ9NS98 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3GQ9NS98 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3GQ9NS98 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3GQ9NS98 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3GQ9NS98 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3GQ9NS98 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3GQ9NS98 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3GQ9NS98 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3GQ9NS98 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3GQ9NS98 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3GQ9NS98 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms