Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM9Q9NQV7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM9Q9NQV7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM9Q9NQV7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM9Q9NQV7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM9Q9NQV7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM9Q9NQV7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM9Q9NQV7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM9Q9NQV7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM9Q9NQV7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM9Q9NQV7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM9Q9NQV7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM9Q9NQV7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM9Q9NQV7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM9Q9NQV7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM9Q9NQV7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM9Q9NQV7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM9Q9NQV7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM9Q9NQV7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM9Q9NQV7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM9Q9NQV7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM9Q9NQV7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM9Q9NQV7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM9Q9NQV7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM9Q9NQV7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM9Q9NQV7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM9Q9NQV7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM9Q9NQV7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM9Q9NQV7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM9Q9NQV7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM9Q9NQV7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM9Q9NQV7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM9Q9NQV7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM9Q9NQV7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM9Q9NQV7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM9Q9NQV7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM9Q9NQV7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM9Q9NQV7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM9Q9NQV7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM9Q9NQV7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM9Q9NQV7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM9Q9NQV7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM9Q9NQV7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM9Q9NQV7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM9Q9NQV7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms