Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP13A2Q9NQ11 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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