Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SARS2Q9NP81 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SARS2Q9NP81 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SARS2Q9NP81 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SARS2Q9NP81 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SARS2Q9NP81 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SARS2Q9NP81 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SARS2Q9NP81 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SARS2Q9NP81 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SARS2Q9NP81 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SARS2Q9NP81 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SARS2Q9NP81 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SARS2Q9NP81 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SARS2Q9NP81 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SARS2Q9NP81 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SARS2Q9NP81 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SARS2Q9NP81 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SARS2Q9NP81 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SARS2Q9NP81 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SARS2Q9NP81 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SARS2Q9NP81 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SARS2Q9NP81 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SARS2Q9NP81 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SARS2Q9NP81 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SARS2Q9NP81 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SARS2Q9NP81 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SARS2Q9NP81 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SARS2Q9NP81 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SARS2Q9NP81 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SARS2Q9NP81 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SARS2Q9NP81 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SARS2Q9NP81 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SARS2Q9NP81 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SARS2Q9NP81 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SARS2Q9NP81 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SARS2Q9NP81 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SARS2Q9NP81 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SARS2Q9NP81 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARS2Q9NP81 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SARS2Q9NP81 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SARS2Q9NP81 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SARS2Q9NP81 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SARS2Q9NP81 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SARS2Q9NP81 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SARS2Q9NP81 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SARS2Q9NP81 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SARS2Q9NP81 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SARS2Q9NP81 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SARS2Q9NP81 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SARS2Q9NP81 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SARS2Q9NP81 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SARS2Q9NP81 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SARS2Q9NP81 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SARS2Q9NP81 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SARS2Q9NP81 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SARS2Q9NP81 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SARS2Q9NP81 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SARS2Q9NP81 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SARS2Q9NP81 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SARS2Q9NP81 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms