Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BPIFA1Q9NP55 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BPIFA1Q9NP55 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BPIFA1Q9NP55 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BPIFA1Q9NP55 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BPIFA1Q9NP55 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BPIFA1Q9NP55 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BPIFA1Q9NP55 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BPIFA1Q9NP55 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BPIFA1Q9NP55 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BPIFA1Q9NP55 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BPIFA1Q9NP55 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BPIFA1Q9NP55 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BPIFA1Q9NP55 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BPIFA1Q9NP55 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BPIFA1Q9NP55 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BPIFA1Q9NP55 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BPIFA1Q9NP55 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BPIFA1Q9NP55 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BPIFA1Q9NP55 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BPIFA1Q9NP55 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BPIFA1Q9NP55 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BPIFA1Q9NP55 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BPIFA1Q9NP55 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BPIFA1Q9NP55 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BPIFA1Q9NP55 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BPIFA1Q9NP55 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BPIFA1Q9NP55 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BPIFA1Q9NP55 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BPIFA1Q9NP55 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BPIFA1Q9NP55 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BPIFA1Q9NP55 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BPIFA1Q9NP55 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BPIFA1Q9NP55 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BPIFA1Q9NP55 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BPIFA1Q9NP55 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BPIFA1Q9NP55 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BPIFA1Q9NP55 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BPIFA1Q9NP55 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BPIFA1Q9NP55 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BPIFA1Q9NP55 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BPIFA1Q9NP55 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BPIFA1Q9NP55 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BPIFA1Q9NP55 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BPIFA1Q9NP55 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BPIFA1Q9NP55 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BPIFA1Q9NP55 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BPIFA1Q9NP55 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BPIFA1Q9NP55 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BPIFA1Q9NP55 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BPIFA1Q9NP55 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BPIFA1Q9NP55 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BPIFA1Q9NP55 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BPIFA1Q9NP55 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BPIFA1Q9NP55 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BPIFA1Q9NP55 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BPIFA1Q9NP55 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BPIFA1Q9NP55 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BPIFA1Q9NP55 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BPIFA1Q9NP55 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BPIFA1Q9NP55 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BPIFA1Q9NP55 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BPIFA1Q9NP55 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BPIFA1Q9NP55 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BPIFA1Q9NP55 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BPIFA1Q9NP55 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BPIFA1Q9NP55 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BPIFA1Q9NP55 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BPIFA1Q9NP55 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BPIFA1Q9NP55 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BPIFA1Q9NP55 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BPIFA1Q9NP55 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BPIFA1Q9NP55 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BPIFA1Q9NP55 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BPIFA1Q9NP55 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BPIFA1Q9NP55 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BPIFA1Q9NP55 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BPIFA1Q9NP55 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BPIFA1Q9NP55 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BPIFA1Q9NP55 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BPIFA1Q9NP55 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BPIFA1Q9NP55 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BPIFA1Q9NP55 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BPIFA1Q9NP55 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BPIFA1Q9NP55 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms