Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNRC6CQ9HCJ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNRC6CQ9HCJ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNRC6CQ9HCJ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNRC6CQ9HCJ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNRC6CQ9HCJ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TNRC6CQ9HCJ0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNRC6CQ9HCJ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNRC6CQ9HCJ0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNRC6CQ9HCJ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNRC6CQ9HCJ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNRC6CQ9HCJ0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNRC6CQ9HCJ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNRC6CQ9HCJ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNRC6CQ9HCJ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNRC6CQ9HCJ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNRC6CQ9HCJ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNRC6CQ9HCJ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNRC6CQ9HCJ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNRC6CQ9HCJ0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNRC6CQ9HCJ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNRC6CQ9HCJ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNRC6CQ9HCJ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNRC6CQ9HCJ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNRC6CQ9HCJ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNRC6CQ9HCJ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNRC6CQ9HCJ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNRC6CQ9HCJ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNRC6CQ9HCJ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNRC6CQ9HCJ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNRC6CQ9HCJ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNRC6CQ9HCJ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
TNRC6CQ9HCJ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNRC6CQ9HCJ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNRC6CQ9HCJ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNRC6CQ9HCJ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNRC6CQ9HCJ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNRC6CQ9HCJ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNRC6CQ9HCJ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNRC6CQ9HCJ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNRC6CQ9HCJ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNRC6CQ9HCJ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNRC6CQ9HCJ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNRC6CQ9HCJ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNRC6CQ9HCJ0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNRC6CQ9HCJ0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNRC6CQ9HCJ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNRC6CQ9HCJ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNRC6CQ9HCJ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TNRC6CQ9HCJ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNRC6CQ9HCJ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNRC6CQ9HCJ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNRC6CQ9HCJ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNRC6CQ9HCJ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNRC6CQ9HCJ0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNRC6CQ9HCJ0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNRC6CQ9HCJ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNRC6CQ9HCJ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TNRC6CQ9HCJ0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNRC6CQ9HCJ0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNRC6CQ9HCJ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNRC6CQ9HCJ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNRC6CQ9HCJ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNRC6CQ9HCJ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
TNRC6CQ9HCJ0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNRC6CQ9HCJ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNRC6CQ9HCJ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNRC6CQ9HCJ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNRC6CQ9HCJ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNRC6CQ9HCJ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNRC6CQ9HCJ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNRC6CQ9HCJ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNRC6CQ9HCJ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
TNRC6CQ9HCJ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
TNRC6CQ9HCJ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNRC6CQ9HCJ0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNRC6CQ9HCJ0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNRC6CQ9HCJ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNRC6CQ9HCJ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNRC6CQ9HCJ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNRC6CQ9HCJ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNRC6CQ9HCJ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNRC6CQ9HCJ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
TNRC6CQ9HCJ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNRC6CQ9HCJ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TNRC6CQ9HCJ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TNRC6CQ9HCJ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TNRC6CQ9HCJ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TNRC6CQ9HCJ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.78■■■■□ 3
TNRC6CQ9HCJ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TNRC6CQ9HCJ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
TNRC6CQ9HCJ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNRC6CQ9HCJ0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNRC6CQ9HCJ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNRC6CQ9HCJ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms