Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CBX8Q9HC52 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CBX8Q9HC52 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CBX8Q9HC52 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CBX8Q9HC52 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CBX8Q9HC52 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CBX8Q9HC52 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CBX8Q9HC52 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CBX8Q9HC52 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CBX8Q9HC52 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CBX8Q9HC52 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CBX8Q9HC52 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CBX8Q9HC52 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CBX8Q9HC52 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CBX8Q9HC52 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CBX8Q9HC52 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CBX8Q9HC52 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CBX8Q9HC52 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CBX8Q9HC52 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CBX8Q9HC52 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CBX8Q9HC52 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CBX8Q9HC52 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CBX8Q9HC52 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CBX8Q9HC52 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CBX8Q9HC52 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CBX8Q9HC52 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CBX8Q9HC52 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CBX8Q9HC52 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CBX8Q9HC52 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CBX8Q9HC52 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CBX8Q9HC52 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CBX8Q9HC52 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CBX8Q9HC52 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CBX8Q9HC52 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CBX8Q9HC52 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CBX8Q9HC52 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CBX8Q9HC52 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CBX8Q9HC52 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CBX8Q9HC52 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CBX8Q9HC52 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CBX8Q9HC52 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CBX8Q9HC52 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CBX8Q9HC52 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CBX8Q9HC52 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CBX8Q9HC52 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CBX8Q9HC52 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CBX8Q9HC52 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CBX8Q9HC52 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CBX8Q9HC52 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CBX8Q9HC52 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CBX8Q9HC52 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CBX8Q9HC52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CBX8Q9HC52 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CBX8Q9HC52 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CBX8Q9HC52 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CBX8Q9HC52 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CBX8Q9HC52 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CBX8Q9HC52 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CBX8Q9HC52 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CBX8Q9HC52 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CBX8Q9HC52 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CBX8Q9HC52 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CBX8Q9HC52 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CBX8Q9HC52 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CBX8Q9HC52 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CBX8Q9HC52 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CBX8Q9HC52 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CBX8Q9HC52 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CBX8Q9HC52 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CBX8Q9HC52 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CBX8Q9HC52 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CBX8Q9HC52 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CBX8Q9HC52 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CBX8Q9HC52 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CBX8Q9HC52 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CBX8Q9HC52 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CBX8Q9HC52 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CBX8Q9HC52 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CBX8Q9HC52 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CBX8Q9HC52 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CBX8Q9HC52 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CBX8Q9HC52 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CBX8Q9HC52 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CBX8Q9HC52 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CBX8Q9HC52 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CBX8Q9HC52 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CBX8Q9HC52 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CBX8Q9HC52 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CBX8Q9HC52 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CBX8Q9HC52 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CBX8Q9HC52 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CBX8Q9HC52 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CBX8Q9HC52 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CBX8Q9HC52 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CBX8Q9HC52 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CBX8Q9HC52 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CBX8Q9HC52 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CBX8Q9HC52 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CBX8Q9HC52 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CBX8Q9HC52 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms