Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
SCAF1Q9H7N4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SCAF1Q9H7N4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SCAF1Q9H7N4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
SCAF1Q9H7N4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SCAF1Q9H7N4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SCAF1Q9H7N4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SCAF1Q9H7N4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
SCAF1Q9H7N4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SCAF1Q9H7N4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
SCAF1Q9H7N4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SCAF1Q9H7N4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SCAF1Q9H7N4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SCAF1Q9H7N4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SCAF1Q9H7N4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SCAF1Q9H7N4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
SCAF1Q9H7N4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
SCAF1Q9H7N4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SCAF1Q9H7N4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SCAF1Q9H7N4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
SCAF1Q9H7N4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SCAF1Q9H7N4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SCAF1Q9H7N4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SCAF1Q9H7N4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SCAF1Q9H7N4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
SCAF1Q9H7N4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SCAF1Q9H7N4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
SCAF1Q9H7N4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
SCAF1Q9H7N4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SCAF1Q9H7N4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SCAF1Q9H7N4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SCAF1Q9H7N4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SCAF1Q9H7N4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SCAF1Q9H7N4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
SCAF1Q9H7N4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SCAF1Q9H7N4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SCAF1Q9H7N4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SCAF1Q9H7N4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SCAF1Q9H7N4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
SCAF1Q9H7N4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SCAF1Q9H7N4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SCAF1Q9H7N4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SCAF1Q9H7N4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
SCAF1Q9H7N4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SCAF1Q9H7N4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SCAF1Q9H7N4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SCAF1Q9H7N4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SCAF1Q9H7N4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SCAF1Q9H7N4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SCAF1Q9H7N4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SCAF1Q9H7N4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SCAF1Q9H7N4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SCAF1Q9H7N4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
SCAF1Q9H7N4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
SCAF1Q9H7N4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
SCAF1Q9H7N4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
SCAF1Q9H7N4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
SCAF1Q9H7N4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
SCAF1Q9H7N4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
SCAF1Q9H7N4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SCAF1Q9H7N4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
SCAF1Q9H7N4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
SCAF1Q9H7N4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
SCAF1Q9H7N4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
SCAF1Q9H7N4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
SCAF1Q9H7N4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SCAF1Q9H7N4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SCAF1Q9H7N4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
SCAF1Q9H7N4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SCAF1Q9H7N4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SCAF1Q9H7N4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SCAF1Q9H7N4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
SCAF1Q9H7N4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SCAF1Q9H7N4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SCAF1Q9H7N4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SCAF1Q9H7N4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SCAF1Q9H7N4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SCAF1Q9H7N4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
SCAF1Q9H7N4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
SCAF1Q9H7N4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
SCAF1Q9H7N4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
SCAF1Q9H7N4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SCAF1Q9H7N4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SCAF1Q9H7N4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SCAF1Q9H7N4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.52■■■■□ 3.92
SCAF1Q9H7N4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SCAF1Q9H7N4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
SCAF1Q9H7N4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
SCAF1Q9H7N4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SCAF1Q9H7N4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SCAF1Q9H7N4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SCAF1Q9H7N4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SCAF1Q9H7N4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SCAF1Q9H7N4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SCAF1Q9H7N4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
SCAF1Q9H7N4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SCAF1Q9H7N4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SCAF1Q9H7N4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SCAF1Q9H7N4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms