Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXO5Q9H790 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXO5Q9H790 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EXO5Q9H790 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXO5Q9H790 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXO5Q9H790 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXO5Q9H790 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXO5Q9H790 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXO5Q9H790 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXO5Q9H790 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EXO5Q9H790 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXO5Q9H790 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXO5Q9H790 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXO5Q9H790 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXO5Q9H790 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXO5Q9H790 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXO5Q9H790 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXO5Q9H790 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXO5Q9H790 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXO5Q9H790 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXO5Q9H790 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXO5Q9H790 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXO5Q9H790 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms