Protein–RNA interactions for Protein: Q9H707

ZNF552, Zinc finger protein 552, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF552Q9H707 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF552Q9H707 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF552Q9H707 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF552Q9H707 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF552Q9H707 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF552Q9H707 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF552Q9H707 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF552Q9H707 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF552Q9H707 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF552Q9H707 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF552Q9H707 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF552Q9H707 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF552Q9H707 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF552Q9H707 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF552Q9H707 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF552Q9H707 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF552Q9H707 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF552Q9H707 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF552Q9H707 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF552Q9H707 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF552Q9H707 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF552Q9H707 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF552Q9H707 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF552Q9H707 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF552Q9H707 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF552Q9H707 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF552Q9H707 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF552Q9H707 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF552Q9H707 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF552Q9H707 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF552Q9H707 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF552Q9H707 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF552Q9H707 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF552Q9H707 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF552Q9H707 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF552Q9H707 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF552Q9H707 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF552Q9H707 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF552Q9H707 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF552Q9H707 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF552Q9H707 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms