Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A9

PCNX3, Pecanex-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX3Q9H6A9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX3Q9H6A9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX3Q9H6A9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX3Q9H6A9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX3Q9H6A9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX3Q9H6A9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX3Q9H6A9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX3Q9H6A9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX3Q9H6A9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX3Q9H6A9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX3Q9H6A9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX3Q9H6A9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX3Q9H6A9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX3Q9H6A9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX3Q9H6A9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX3Q9H6A9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX3Q9H6A9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNX3Q9H6A9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNX3Q9H6A9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNX3Q9H6A9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCNX3Q9H6A9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCNX3Q9H6A9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCNX3Q9H6A9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCNX3Q9H6A9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCNX3Q9H6A9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCNX3Q9H6A9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCNX3Q9H6A9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCNX3Q9H6A9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCNX3Q9H6A9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCNX3Q9H6A9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCNX3Q9H6A9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCNX3Q9H6A9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCNX3Q9H6A9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCNX3Q9H6A9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNX3Q9H6A9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNX3Q9H6A9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNX3Q9H6A9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNX3Q9H6A9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNX3Q9H6A9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNX3Q9H6A9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNX3Q9H6A9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNX3Q9H6A9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNX3Q9H6A9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNX3Q9H6A9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNX3Q9H6A9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms