Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC68Q9H2F9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC68Q9H2F9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC68Q9H2F9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC68Q9H2F9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC68Q9H2F9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC68Q9H2F9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC68Q9H2F9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC68Q9H2F9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC68Q9H2F9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC68Q9H2F9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC68Q9H2F9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC68Q9H2F9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC68Q9H2F9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC68Q9H2F9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC68Q9H2F9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC68Q9H2F9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC68Q9H2F9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC68Q9H2F9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC68Q9H2F9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC68Q9H2F9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC68Q9H2F9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC68Q9H2F9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC68Q9H2F9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC68Q9H2F9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC68Q9H2F9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC68Q9H2F9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC68Q9H2F9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC68Q9H2F9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC68Q9H2F9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC68Q9H2F9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC68Q9H2F9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC68Q9H2F9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC68Q9H2F9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC68Q9H2F9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC68Q9H2F9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC68Q9H2F9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC68Q9H2F9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC68Q9H2F9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC68Q9H2F9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC68Q9H2F9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC68Q9H2F9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC68Q9H2F9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC68Q9H2F9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC68Q9H2F9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC68Q9H2F9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC68Q9H2F9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC68Q9H2F9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC68Q9H2F9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC68Q9H2F9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC68Q9H2F9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC68Q9H2F9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC68Q9H2F9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC68Q9H2F9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC68Q9H2F9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC68Q9H2F9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC68Q9H2F9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC68Q9H2F9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC68Q9H2F9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC68Q9H2F9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC68Q9H2F9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC68Q9H2F9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC68Q9H2F9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC68Q9H2F9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC68Q9H2F9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC68Q9H2F9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC68Q9H2F9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC68Q9H2F9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC68Q9H2F9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC68Q9H2F9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC68Q9H2F9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC68Q9H2F9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC68Q9H2F9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC68Q9H2F9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC68Q9H2F9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC68Q9H2F9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC68Q9H2F9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC68Q9H2F9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC68Q9H2F9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC68Q9H2F9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC68Q9H2F9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC68Q9H2F9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC68Q9H2F9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC68Q9H2F9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms