Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZV3

SLC5A7, High affinity choline transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A7Q9GZV3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A7Q9GZV3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A7Q9GZV3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A7Q9GZV3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A7Q9GZV3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A7Q9GZV3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A7Q9GZV3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A7Q9GZV3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A7Q9GZV3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A7Q9GZV3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A7Q9GZV3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A7Q9GZV3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A7Q9GZV3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A7Q9GZV3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A7Q9GZV3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A7Q9GZV3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A7Q9GZV3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A7Q9GZV3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A7Q9GZV3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A7Q9GZV3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC5A7Q9GZV3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A7Q9GZV3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC5A7Q9GZV3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A7Q9GZV3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A7Q9GZV3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC5A7Q9GZV3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC5A7Q9GZV3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A7Q9GZV3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC5A7Q9GZV3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A7Q9GZV3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A7Q9GZV3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC5A7Q9GZV3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A7Q9GZV3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC5A7Q9GZV3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A7Q9GZV3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC5A7Q9GZV3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A7Q9GZV3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A7Q9GZV3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A7Q9GZV3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC5A7Q9GZV3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC5A7Q9GZV3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC5A7Q9GZV3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A7Q9GZV3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A7Q9GZV3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A7Q9GZV3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A7Q9GZV3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A7Q9GZV3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A7Q9GZV3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A7Q9GZV3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A7Q9GZV3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A7Q9GZV3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A7Q9GZV3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A7Q9GZV3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A7Q9GZV3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A7Q9GZV3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A7Q9GZV3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms