Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM31Q9BZY9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM31Q9BZY9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM31Q9BZY9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM31Q9BZY9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM31Q9BZY9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM31Q9BZY9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM31Q9BZY9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM31Q9BZY9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM31Q9BZY9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM31Q9BZY9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM31Q9BZY9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM31Q9BZY9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM31Q9BZY9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM31Q9BZY9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM31Q9BZY9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM31Q9BZY9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM31Q9BZY9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM31Q9BZY9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM31Q9BZY9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM31Q9BZY9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM31Q9BZY9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM31Q9BZY9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM31Q9BZY9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM31Q9BZY9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM31Q9BZY9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM31Q9BZY9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM31Q9BZY9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM31Q9BZY9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM31Q9BZY9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM31Q9BZY9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM31Q9BZY9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM31Q9BZY9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM31Q9BZY9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM31Q9BZY9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM31Q9BZY9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM31Q9BZY9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM31Q9BZY9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM31Q9BZY9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM31Q9BZY9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM31Q9BZY9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM31Q9BZY9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM31Q9BZY9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM31Q9BZY9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM31Q9BZY9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM31Q9BZY9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM31Q9BZY9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM31Q9BZY9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM31Q9BZY9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM31Q9BZY9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM31Q9BZY9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM31Q9BZY9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM31Q9BZY9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM31Q9BZY9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM31Q9BZY9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM31Q9BZY9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM31Q9BZY9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM31Q9BZY9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM31Q9BZY9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM31Q9BZY9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM31Q9BZY9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM31Q9BZY9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM31Q9BZY9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM31Q9BZY9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM31Q9BZY9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM31Q9BZY9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM31Q9BZY9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM31Q9BZY9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM31Q9BZY9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM31Q9BZY9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM31Q9BZY9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM31Q9BZY9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM31Q9BZY9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM31Q9BZY9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM31Q9BZY9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM31Q9BZY9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM31Q9BZY9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM31Q9BZY9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM31Q9BZY9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM31Q9BZY9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM31Q9BZY9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM31Q9BZY9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM31Q9BZY9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM31Q9BZY9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM31Q9BZY9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM31Q9BZY9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms