Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNHG12Q9BXW3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNHG12Q9BXW3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNHG12Q9BXW3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNHG12Q9BXW3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNHG12Q9BXW3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNHG12Q9BXW3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNHG12Q9BXW3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNHG12Q9BXW3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNHG12Q9BXW3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNHG12Q9BXW3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNHG12Q9BXW3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNHG12Q9BXW3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNHG12Q9BXW3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNHG12Q9BXW3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNHG12Q9BXW3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNHG12Q9BXW3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNHG12Q9BXW3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNHG12Q9BXW3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNHG12Q9BXW3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNHG12Q9BXW3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNHG12Q9BXW3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNHG12Q9BXW3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SNHG12Q9BXW3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms