Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PLVAPQ9BX97 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms