Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PLVAPQ9BX97 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PLVAPQ9BX97 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLVAPQ9BX97 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PLVAPQ9BX97 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLVAPQ9BX97 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLVAPQ9BX97 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLVAPQ9BX97 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLVAPQ9BX97 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms