Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
JAM3Q9BX67 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JAM3Q9BX67 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
JAM3Q9BX67 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JAM3Q9BX67 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JAM3Q9BX67 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
JAM3Q9BX67 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JAM3Q9BX67 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
JAM3Q9BX67 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
JAM3Q9BX67 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
JAM3Q9BX67 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
JAM3Q9BX67 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
JAM3Q9BX67 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
JAM3Q9BX67 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
JAM3Q9BX67 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
JAM3Q9BX67 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
JAM3Q9BX67 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
JAM3Q9BX67 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
JAM3Q9BX67 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
JAM3Q9BX67 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
JAM3Q9BX67 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
JAM3Q9BX67 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
JAM3Q9BX67 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
JAM3Q9BX67 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
JAM3Q9BX67 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
JAM3Q9BX67 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
JAM3Q9BX67 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
JAM3Q9BX67 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
JAM3Q9BX67 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
JAM3Q9BX67 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
JAM3Q9BX67 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
JAM3Q9BX67 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
JAM3Q9BX67 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JAM3Q9BX67 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JAM3Q9BX67 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
JAM3Q9BX67 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JAM3Q9BX67 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
JAM3Q9BX67 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
JAM3Q9BX67 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JAM3Q9BX67 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
JAM3Q9BX67 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
JAM3Q9BX67 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
JAM3Q9BX67 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
JAM3Q9BX67 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
JAM3Q9BX67 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
JAM3Q9BX67 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
JAM3Q9BX67 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
JAM3Q9BX67 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JAM3Q9BX67 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
JAM3Q9BX67 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
JAM3Q9BX67 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
JAM3Q9BX67 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JAM3Q9BX67 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JAM3Q9BX67 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
JAM3Q9BX67 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JAM3Q9BX67 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JAM3Q9BX67 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JAM3Q9BX67 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
JAM3Q9BX67 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
JAM3Q9BX67 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAM3Q9BX67 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAM3Q9BX67 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAM3Q9BX67 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JAM3Q9BX67 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
JAM3Q9BX67 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
JAM3Q9BX67 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
JAM3Q9BX67 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
JAM3Q9BX67 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
JAM3Q9BX67 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
JAM3Q9BX67 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
JAM3Q9BX67 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
JAM3Q9BX67 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
JAM3Q9BX67 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
JAM3Q9BX67 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
JAM3Q9BX67 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
JAM3Q9BX67 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
JAM3Q9BX67 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
JAM3Q9BX67 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
JAM3Q9BX67 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
JAM3Q9BX67 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
JAM3Q9BX67 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms