Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSBP3Q9BWW4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SSBP3Q9BWW4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSBP3Q9BWW4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSBP3Q9BWW4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSBP3Q9BWW4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSBP3Q9BWW4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSBP3Q9BWW4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSBP3Q9BWW4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSBP3Q9BWW4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SSBP3Q9BWW4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSBP3Q9BWW4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSBP3Q9BWW4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSBP3Q9BWW4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SSBP3Q9BWW4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSBP3Q9BWW4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSBP3Q9BWW4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSBP3Q9BWW4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSBP3Q9BWW4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms