Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMUB1Q9BVT8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMUB1Q9BVT8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMUB1Q9BVT8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMUB1Q9BVT8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMUB1Q9BVT8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMUB1Q9BVT8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMUB1Q9BVT8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMUB1Q9BVT8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMUB1Q9BVT8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMUB1Q9BVT8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMUB1Q9BVT8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMUB1Q9BVT8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMUB1Q9BVT8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMUB1Q9BVT8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMUB1Q9BVT8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMUB1Q9BVT8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMUB1Q9BVT8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMUB1Q9BVT8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMUB1Q9BVT8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMUB1Q9BVT8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMUB1Q9BVT8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMUB1Q9BVT8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMUB1Q9BVT8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMUB1Q9BVT8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMUB1Q9BVT8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMUB1Q9BVT8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMUB1Q9BVT8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMUB1Q9BVT8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMUB1Q9BVT8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMUB1Q9BVT8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMUB1Q9BVT8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMUB1Q9BVT8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMUB1Q9BVT8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMUB1Q9BVT8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMUB1Q9BVT8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMUB1Q9BVT8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMUB1Q9BVT8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMUB1Q9BVT8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMUB1Q9BVT8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMUB1Q9BVT8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMUB1Q9BVT8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMUB1Q9BVT8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMUB1Q9BVT8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMUB1Q9BVT8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMUB1Q9BVT8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMUB1Q9BVT8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMUB1Q9BVT8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMUB1Q9BVT8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMUB1Q9BVT8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms