Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRC7

PLCD4, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCD4Q9BRC7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLCD4Q9BRC7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLCD4Q9BRC7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLCD4Q9BRC7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLCD4Q9BRC7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLCD4Q9BRC7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLCD4Q9BRC7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLCD4Q9BRC7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLCD4Q9BRC7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLCD4Q9BRC7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLCD4Q9BRC7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLCD4Q9BRC7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLCD4Q9BRC7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLCD4Q9BRC7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLCD4Q9BRC7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLCD4Q9BRC7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLCD4Q9BRC7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLCD4Q9BRC7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLCD4Q9BRC7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLCD4Q9BRC7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLCD4Q9BRC7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLCD4Q9BRC7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLCD4Q9BRC7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLCD4Q9BRC7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLCD4Q9BRC7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLCD4Q9BRC7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLCD4Q9BRC7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLCD4Q9BRC7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLCD4Q9BRC7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLCD4Q9BRC7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PLCD4Q9BRC7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLCD4Q9BRC7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLCD4Q9BRC7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLCD4Q9BRC7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLCD4Q9BRC7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLCD4Q9BRC7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLCD4Q9BRC7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLCD4Q9BRC7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLCD4Q9BRC7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLCD4Q9BRC7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLCD4Q9BRC7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLCD4Q9BRC7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLCD4Q9BRC7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLCD4Q9BRC7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLCD4Q9BRC7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLCD4Q9BRC7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLCD4Q9BRC7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLCD4Q9BRC7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLCD4Q9BRC7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLCD4Q9BRC7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLCD4Q9BRC7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLCD4Q9BRC7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLCD4Q9BRC7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PLCD4Q9BRC7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLCD4Q9BRC7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLCD4Q9BRC7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLCD4Q9BRC7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLCD4Q9BRC7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLCD4Q9BRC7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLCD4Q9BRC7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLCD4Q9BRC7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLCD4Q9BRC7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLCD4Q9BRC7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLCD4Q9BRC7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLCD4Q9BRC7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLCD4Q9BRC7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLCD4Q9BRC7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLCD4Q9BRC7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLCD4Q9BRC7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLCD4Q9BRC7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLCD4Q9BRC7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLCD4Q9BRC7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms