Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR39

JPH2, Junctophilin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH2Q9BR39 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
JPH2Q9BR39 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
JPH2Q9BR39 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
JPH2Q9BR39 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
JPH2Q9BR39 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
JPH2Q9BR39 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
JPH2Q9BR39 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
JPH2Q9BR39 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
JPH2Q9BR39 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
JPH2Q9BR39 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
JPH2Q9BR39 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
JPH2Q9BR39 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
JPH2Q9BR39 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
JPH2Q9BR39 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
JPH2Q9BR39 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
JPH2Q9BR39 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
JPH2Q9BR39 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
JPH2Q9BR39 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
JPH2Q9BR39 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
JPH2Q9BR39 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
JPH2Q9BR39 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
JPH2Q9BR39 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
JPH2Q9BR39 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
JPH2Q9BR39 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
JPH2Q9BR39 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
JPH2Q9BR39 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
JPH2Q9BR39 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
JPH2Q9BR39 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
JPH2Q9BR39 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
JPH2Q9BR39 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
JPH2Q9BR39 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
JPH2Q9BR39 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
JPH2Q9BR39 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
JPH2Q9BR39 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30■■■□□ 2.39
JPH2Q9BR39 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
JPH2Q9BR39 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
JPH2Q9BR39 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
JPH2Q9BR39 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
JPH2Q9BR39 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
JPH2Q9BR39 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
JPH2Q9BR39 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
JPH2Q9BR39 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
JPH2Q9BR39 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
JPH2Q9BR39 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
JPH2Q9BR39 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
JPH2Q9BR39 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
JPH2Q9BR39 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
JPH2Q9BR39 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
JPH2Q9BR39 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
JPH2Q9BR39 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
JPH2Q9BR39 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
JPH2Q9BR39 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
JPH2Q9BR39 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
JPH2Q9BR39 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
JPH2Q9BR39 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
JPH2Q9BR39 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
JPH2Q9BR39 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
JPH2Q9BR39 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
JPH2Q9BR39 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
JPH2Q9BR39 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
JPH2Q9BR39 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
JPH2Q9BR39 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
JPH2Q9BR39 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
JPH2Q9BR39 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
JPH2Q9BR39 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
JPH2Q9BR39 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
JPH2Q9BR39 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
JPH2Q9BR39 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
JPH2Q9BR39 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
JPH2Q9BR39 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
JPH2Q9BR39 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
JPH2Q9BR39 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
JPH2Q9BR39 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
JPH2Q9BR39 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
JPH2Q9BR39 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
JPH2Q9BR39 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
JPH2Q9BR39 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
JPH2Q9BR39 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
JPH2Q9BR39 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
JPH2Q9BR39 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
JPH2Q9BR39 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
JPH2Q9BR39 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
JPH2Q9BR39 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms