Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AKAP9Q99996 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AKAP9Q99996 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AKAP9Q99996 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AKAP9Q99996 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AKAP9Q99996 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AKAP9Q99996 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AKAP9Q99996 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AKAP9Q99996 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AKAP9Q99996 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AKAP9Q99996 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AKAP9Q99996 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AKAP9Q99996 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AKAP9Q99996 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AKAP9Q99996 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AKAP9Q99996 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AKAP9Q99996 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AKAP9Q99996 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AKAP9Q99996 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AKAP9Q99996 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AKAP9Q99996 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AKAP9Q99996 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AKAP9Q99996 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AKAP9Q99996 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AKAP9Q99996 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AKAP9Q99996 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AKAP9Q99996 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AKAP9Q99996 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AKAP9Q99996 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AKAP9Q99996 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AKAP9Q99996 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AKAP9Q99996 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP9Q99996 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP9Q99996 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP9Q99996 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP9Q99996 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP9Q99996 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP9Q99996 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP9Q99996 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP9Q99996 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP9Q99996 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AKAP9Q99996 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AKAP9Q99996 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
AKAP9Q99996 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AKAP9Q99996 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AKAP9Q99996 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AKAP9Q99996 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AKAP9Q99996 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AKAP9Q99996 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP9Q99996 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP9Q99996 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP9Q99996 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP9Q99996 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP9Q99996 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP9Q99996 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP9Q99996 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AKAP9Q99996 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AKAP9Q99996 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP9Q99996 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP9Q99996 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP9Q99996 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AKAP9Q99996 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP9Q99996 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP9Q99996 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP9Q99996 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AKAP9Q99996 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AKAP9Q99996 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP9Q99996 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP9Q99996 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP9Q99996 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP9Q99996 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP9Q99996 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP9Q99996 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP9Q99996 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP9Q99996 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP9Q99996 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP9Q99996 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP9Q99996 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP9Q99996 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP9Q99996 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AKAP9Q99996 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AKAP9Q99996 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AKAP9Q99996 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AKAP9Q99996 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AKAP9Q99996 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AKAP9Q99996 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AKAP9Q99996 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AKAP9Q99996 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AKAP9Q99996 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP9Q99996 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP9Q99996 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AKAP9Q99996 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AKAP9Q99996 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AKAP9Q99996 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP9Q99996 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP9Q99996 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP9Q99996 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AKAP9Q99996 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP9Q99996 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AKAP9Q99996 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms