Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3AQ99856 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3AQ99856 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3AQ99856 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID3AQ99856 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID3AQ99856 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3AQ99856 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3AQ99856 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3AQ99856 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3AQ99856 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3AQ99856 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3AQ99856 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3AQ99856 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3AQ99856 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID3AQ99856 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3AQ99856 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3AQ99856 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3AQ99856 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3AQ99856 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3AQ99856 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3AQ99856 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID3AQ99856 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARID3AQ99856 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3AQ99856 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3AQ99856 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3AQ99856 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3AQ99856 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3AQ99856 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3AQ99856 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3AQ99856 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3AQ99856 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3AQ99856 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID3AQ99856 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ARID3AQ99856 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ARID3AQ99856 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID3AQ99856 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID3AQ99856 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID3AQ99856 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID3AQ99856 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3AQ99856 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3AQ99856 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID3AQ99856 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3AQ99856 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID3AQ99856 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID3AQ99856 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3AQ99856 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3AQ99856 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3AQ99856 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARID3AQ99856 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3AQ99856 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3AQ99856 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3AQ99856 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3AQ99856 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3AQ99856 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3AQ99856 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3AQ99856 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3AQ99856 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3AQ99856 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3AQ99856 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3AQ99856 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3AQ99856 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARID3AQ99856 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ARID3AQ99856 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3AQ99856 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3AQ99856 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3AQ99856 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3AQ99856 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3AQ99856 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3AQ99856 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARID3AQ99856 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARID3AQ99856 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARID3AQ99856 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARID3AQ99856 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3AQ99856 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3AQ99856 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARID3AQ99856 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARID3AQ99856 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3AQ99856 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARID3AQ99856 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3AQ99856 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARID3AQ99856 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3AQ99856 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms