Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LYSTQ99698 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYSTQ99698 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYSTQ99698 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LYSTQ99698 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LYSTQ99698 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
LYSTQ99698 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LYSTQ99698 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYSTQ99698 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYSTQ99698 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms