Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC38A3Q99624 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC38A3Q99624 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC38A3Q99624 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC38A3Q99624 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC38A3Q99624 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC38A3Q99624 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC38A3Q99624 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC38A3Q99624 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC38A3Q99624 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC38A3Q99624 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC38A3Q99624 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC38A3Q99624 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC38A3Q99624 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC38A3Q99624 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC38A3Q99624 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC38A3Q99624 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC38A3Q99624 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC38A3Q99624 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC38A3Q99624 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC38A3Q99624 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC38A3Q99624 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC38A3Q99624 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC38A3Q99624 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC38A3Q99624 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A3Q99624 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A3Q99624 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A3Q99624 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A3Q99624 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC38A3Q99624 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC38A3Q99624 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC38A3Q99624 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC38A3Q99624 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC38A3Q99624 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC38A3Q99624 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC38A3Q99624 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC38A3Q99624 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC38A3Q99624 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC38A3Q99624 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC38A3Q99624 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC38A3Q99624 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC38A3Q99624 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC38A3Q99624 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC38A3Q99624 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC38A3Q99624 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC38A3Q99624 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC38A3Q99624 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC38A3Q99624 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC38A3Q99624 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC38A3Q99624 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC38A3Q99624 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC38A3Q99624 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC38A3Q99624 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC38A3Q99624 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC38A3Q99624 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC38A3Q99624 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC38A3Q99624 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC38A3Q99624 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC38A3Q99624 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC38A3Q99624 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC38A3Q99624 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC38A3Q99624 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC38A3Q99624 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC38A3Q99624 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC38A3Q99624 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC38A3Q99624 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC38A3Q99624 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC38A3Q99624 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC38A3Q99624 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC38A3Q99624 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC38A3Q99624 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC38A3Q99624 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC38A3Q99624 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC38A3Q99624 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC38A3Q99624 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC38A3Q99624 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC38A3Q99624 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC38A3Q99624 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC38A3Q99624 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC38A3Q99624 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC38A3Q99624 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC38A3Q99624 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC38A3Q99624 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC38A3Q99624 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms