Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
MMP19Q99542 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
MMP19Q99542 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
MMP19Q99542 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MMP19Q99542 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MMP19Q99542 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MMP19Q99542 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MMP19Q99542 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MMP19Q99542 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MMP19Q99542 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MMP19Q99542 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MMP19Q99542 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MMP19Q99542 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MMP19Q99542 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MMP19Q99542 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MMP19Q99542 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MMP19Q99542 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MMP19Q99542 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MMP19Q99542 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MMP19Q99542 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MMP19Q99542 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MMP19Q99542 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MMP19Q99542 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
MMP19Q99542 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MMP19Q99542 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MMP19Q99542 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MMP19Q99542 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MMP19Q99542 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MMP19Q99542 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MMP19Q99542 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
MMP19Q99542 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MMP19Q99542 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MMP19Q99542 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MMP19Q99542 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MMP19Q99542 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MMP19Q99542 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MMP19Q99542 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MMP19Q99542 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MMP19Q99542 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MMP19Q99542 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MMP19Q99542 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
MMP19Q99542 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MMP19Q99542 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MMP19Q99542 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MMP19Q99542 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MMP19Q99542 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MMP19Q99542 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MMP19Q99542 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MMP19Q99542 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MMP19Q99542 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MMP19Q99542 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MMP19Q99542 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MMP19Q99542 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MMP19Q99542 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms