Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD8Q96S16 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
JMJD8Q96S16 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JMJD8Q96S16 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JMJD8Q96S16 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
JMJD8Q96S16 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
JMJD8Q96S16 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
JMJD8Q96S16 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JMJD8Q96S16 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
JMJD8Q96S16 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JMJD8Q96S16 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
JMJD8Q96S16 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
JMJD8Q96S16 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22■■□□□ 1.11
JMJD8Q96S16 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
JMJD8Q96S16 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JMJD8Q96S16 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
JMJD8Q96S16 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JMJD8Q96S16 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JMJD8Q96S16 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JMJD8Q96S16 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JMJD8Q96S16 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
JMJD8Q96S16 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JMJD8Q96S16 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
JMJD8Q96S16 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
JMJD8Q96S16 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JMJD8Q96S16 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JMJD8Q96S16 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
JMJD8Q96S16 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
JMJD8Q96S16 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
JMJD8Q96S16 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JMJD8Q96S16 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JMJD8Q96S16 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JMJD8Q96S16 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD8Q96S16 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD8Q96S16 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD8Q96S16 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD8Q96S16 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD8Q96S16 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JMJD8Q96S16 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JMJD8Q96S16 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JMJD8Q96S16 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JMJD8Q96S16 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
JMJD8Q96S16 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JMJD8Q96S16 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JMJD8Q96S16 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JMJD8Q96S16 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JMJD8Q96S16 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD8Q96S16 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD8Q96S16 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD8Q96S16 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD8Q96S16 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD8Q96S16 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD8Q96S16 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD8Q96S16 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JMJD8Q96S16 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JMJD8Q96S16 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
JMJD8Q96S16 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JMJD8Q96S16 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
JMJD8Q96S16 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
JMJD8Q96S16 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JMJD8Q96S16 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JMJD8Q96S16 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JMJD8Q96S16 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
JMJD8Q96S16 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
JMJD8Q96S16 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JMJD8Q96S16 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
JMJD8Q96S16 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JMJD8Q96S16 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JMJD8Q96S16 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
JMJD8Q96S16 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms