Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP9

GFM1, Elongation factor G, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFM1Q96RP9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GFM1Q96RP9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GFM1Q96RP9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GFM1Q96RP9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GFM1Q96RP9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GFM1Q96RP9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GFM1Q96RP9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GFM1Q96RP9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GFM1Q96RP9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GFM1Q96RP9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GFM1Q96RP9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFM1Q96RP9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFM1Q96RP9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GFM1Q96RP9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GFM1Q96RP9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GFM1Q96RP9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GFM1Q96RP9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GFM1Q96RP9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GFM1Q96RP9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GFM1Q96RP9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GFM1Q96RP9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GFM1Q96RP9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GFM1Q96RP9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GFM1Q96RP9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GFM1Q96RP9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GFM1Q96RP9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GFM1Q96RP9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GFM1Q96RP9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GFM1Q96RP9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GFM1Q96RP9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GFM1Q96RP9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GFM1Q96RP9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
GFM1Q96RP9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GFM1Q96RP9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GFM1Q96RP9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GFM1Q96RP9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GFM1Q96RP9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GFM1Q96RP9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GFM1Q96RP9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GFM1Q96RP9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GFM1Q96RP9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GFM1Q96RP9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GFM1Q96RP9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GFM1Q96RP9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GFM1Q96RP9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GFM1Q96RP9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GFM1Q96RP9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GFM1Q96RP9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFM1Q96RP9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFM1Q96RP9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFM1Q96RP9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms