Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DEPDC7Q96QD5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DEPDC7Q96QD5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DEPDC7Q96QD5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DEPDC7Q96QD5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DEPDC7Q96QD5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DEPDC7Q96QD5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DEPDC7Q96QD5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DEPDC7Q96QD5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DEPDC7Q96QD5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DEPDC7Q96QD5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DEPDC7Q96QD5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DEPDC7Q96QD5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DEPDC7Q96QD5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DEPDC7Q96QD5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DEPDC7Q96QD5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DEPDC7Q96QD5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DEPDC7Q96QD5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DEPDC7Q96QD5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DEPDC7Q96QD5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DEPDC7Q96QD5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DEPDC7Q96QD5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DEPDC7Q96QD5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DEPDC7Q96QD5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DEPDC7Q96QD5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DEPDC7Q96QD5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DEPDC7Q96QD5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DEPDC7Q96QD5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DEPDC7Q96QD5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DEPDC7Q96QD5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DEPDC7Q96QD5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DEPDC7Q96QD5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DEPDC7Q96QD5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DEPDC7Q96QD5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DEPDC7Q96QD5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DEPDC7Q96QD5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DEPDC7Q96QD5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DEPDC7Q96QD5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DEPDC7Q96QD5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DEPDC7Q96QD5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DEPDC7Q96QD5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DEPDC7Q96QD5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DEPDC7Q96QD5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DEPDC7Q96QD5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DEPDC7Q96QD5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DEPDC7Q96QD5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DEPDC7Q96QD5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DEPDC7Q96QD5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DEPDC7Q96QD5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DEPDC7Q96QD5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DEPDC7Q96QD5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DEPDC7Q96QD5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEPDC7Q96QD5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEPDC7Q96QD5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DEPDC7Q96QD5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DEPDC7Q96QD5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DEPDC7Q96QD5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DEPDC7Q96QD5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DEPDC7Q96QD5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms