Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALS2CR12Q96Q35 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALS2CR12Q96Q35 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALS2CR12Q96Q35 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2CR12Q96Q35 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2CR12Q96Q35 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2CR12Q96Q35 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALS2CR12Q96Q35 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALS2CR12Q96Q35 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALS2CR12Q96Q35 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALS2CR12Q96Q35 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALS2CR12Q96Q35 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALS2CR12Q96Q35 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALS2CR12Q96Q35 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALS2CR12Q96Q35 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALS2CR12Q96Q35 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALS2CR12Q96Q35 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALS2CR12Q96Q35 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALS2CR12Q96Q35 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALS2CR12Q96Q35 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALS2CR12Q96Q35 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ALS2CR12Q96Q35 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALS2CR12Q96Q35 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALS2CR12Q96Q35 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALS2CR12Q96Q35 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALS2CR12Q96Q35 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALS2CR12Q96Q35 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALS2CR12Q96Q35 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALS2CR12Q96Q35 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALS2CR12Q96Q35 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2CR12Q96Q35 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2CR12Q96Q35 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2CR12Q96Q35 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2CR12Q96Q35 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2CR12Q96Q35 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALS2CR12Q96Q35 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALS2CR12Q96Q35 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ALS2CR12Q96Q35 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALS2CR12Q96Q35 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2CR12Q96Q35 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2CR12Q96Q35 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2CR12Q96Q35 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2CR12Q96Q35 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2CR12Q96Q35 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2CR12Q96Q35 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2CR12Q96Q35 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2CR12Q96Q35 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALS2CR12Q96Q35 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2CR12Q96Q35 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2CR12Q96Q35 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ALS2CR12Q96Q35 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALS2CR12Q96Q35 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2CR12Q96Q35 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2CR12Q96Q35 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2CR12Q96Q35 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALS2CR12Q96Q35 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALS2CR12Q96Q35 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALS2CR12Q96Q35 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALS2CR12Q96Q35 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALS2CR12Q96Q35 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALS2CR12Q96Q35 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALS2CR12Q96Q35 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2CR12Q96Q35 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2CR12Q96Q35 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALS2CR12Q96Q35 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALS2CR12Q96Q35 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALS2CR12Q96Q35 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALS2CR12Q96Q35 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALS2CR12Q96Q35 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms