Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SCLT1Q96NL6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCLT1Q96NL6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCLT1Q96NL6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCLT1Q96NL6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCLT1Q96NL6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCLT1Q96NL6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCLT1Q96NL6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCLT1Q96NL6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCLT1Q96NL6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SCLT1Q96NL6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SCLT1Q96NL6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCLT1Q96NL6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCLT1Q96NL6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCLT1Q96NL6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCLT1Q96NL6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCLT1Q96NL6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCLT1Q96NL6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCLT1Q96NL6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SCLT1Q96NL6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCLT1Q96NL6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SCLT1Q96NL6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCLT1Q96NL6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCLT1Q96NL6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCLT1Q96NL6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCLT1Q96NL6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SCLT1Q96NL6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCLT1Q96NL6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCLT1Q96NL6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCLT1Q96NL6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCLT1Q96NL6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCLT1Q96NL6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCLT1Q96NL6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCLT1Q96NL6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCLT1Q96NL6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCLT1Q96NL6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCLT1Q96NL6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCLT1Q96NL6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCLT1Q96NL6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCLT1Q96NL6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCLT1Q96NL6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCLT1Q96NL6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCLT1Q96NL6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCLT1Q96NL6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCLT1Q96NL6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SCLT1Q96NL6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCLT1Q96NL6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCLT1Q96NL6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCLT1Q96NL6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCLT1Q96NL6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCLT1Q96NL6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCLT1Q96NL6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCLT1Q96NL6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCLT1Q96NL6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SCLT1Q96NL6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCLT1Q96NL6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCLT1Q96NL6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCLT1Q96NL6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCLT1Q96NL6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCLT1Q96NL6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCLT1Q96NL6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCLT1Q96NL6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCLT1Q96NL6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCLT1Q96NL6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCLT1Q96NL6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCLT1Q96NL6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCLT1Q96NL6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SCLT1Q96NL6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCLT1Q96NL6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCLT1Q96NL6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCLT1Q96NL6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCLT1Q96NL6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCLT1Q96NL6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCLT1Q96NL6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCLT1Q96NL6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCLT1Q96NL6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCLT1Q96NL6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCLT1Q96NL6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCLT1Q96NL6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCLT1Q96NL6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCLT1Q96NL6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCLT1Q96NL6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCLT1Q96NL6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCLT1Q96NL6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCLT1Q96NL6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCLT1Q96NL6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCLT1Q96NL6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCLT1Q96NL6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCLT1Q96NL6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCLT1Q96NL6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCLT1Q96NL6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCLT1Q96NL6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCLT1Q96NL6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCLT1Q96NL6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCLT1Q96NL6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCLT1Q96NL6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCLT1Q96NL6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCLT1Q96NL6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCLT1Q96NL6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCLT1Q96NL6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms