Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF145Q96MT1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF145Q96MT1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF145Q96MT1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF145Q96MT1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF145Q96MT1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF145Q96MT1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF145Q96MT1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF145Q96MT1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF145Q96MT1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF145Q96MT1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF145Q96MT1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF145Q96MT1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF145Q96MT1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF145Q96MT1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF145Q96MT1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF145Q96MT1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF145Q96MT1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF145Q96MT1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF145Q96MT1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF145Q96MT1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF145Q96MT1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF145Q96MT1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF145Q96MT1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF145Q96MT1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF145Q96MT1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF145Q96MT1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF145Q96MT1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF145Q96MT1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF145Q96MT1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF145Q96MT1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF145Q96MT1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF145Q96MT1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF145Q96MT1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF145Q96MT1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF145Q96MT1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF145Q96MT1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF145Q96MT1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF145Q96MT1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF145Q96MT1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF145Q96MT1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF145Q96MT1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF145Q96MT1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF145Q96MT1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF145Q96MT1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF145Q96MT1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF145Q96MT1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF145Q96MT1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF145Q96MT1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF145Q96MT1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF145Q96MT1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF145Q96MT1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF145Q96MT1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF145Q96MT1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF145Q96MT1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF145Q96MT1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF145Q96MT1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF145Q96MT1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF145Q96MT1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF145Q96MT1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF145Q96MT1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF145Q96MT1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF145Q96MT1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF145Q96MT1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF145Q96MT1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF145Q96MT1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF145Q96MT1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF145Q96MT1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF145Q96MT1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF145Q96MT1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF145Q96MT1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF145Q96MT1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF145Q96MT1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF145Q96MT1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF145Q96MT1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF145Q96MT1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF145Q96MT1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF145Q96MT1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF145Q96MT1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF145Q96MT1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF145Q96MT1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF145Q96MT1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF145Q96MT1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF145Q96MT1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF145Q96MT1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF145Q96MT1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF145Q96MT1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF145Q96MT1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF145Q96MT1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF145Q96MT1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF145Q96MT1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF145Q96MT1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF145Q96MT1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF145Q96MT1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF145Q96MT1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF145Q96MT1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF145Q96MT1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF145Q96MT1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF145Q96MT1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF145Q96MT1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms