Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKNOX2Q96KN3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PKNOX2Q96KN3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKNOX2Q96KN3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKNOX2Q96KN3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKNOX2Q96KN3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKNOX2Q96KN3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKNOX2Q96KN3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKNOX2Q96KN3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKNOX2Q96KN3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKNOX2Q96KN3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKNOX2Q96KN3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKNOX2Q96KN3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKNOX2Q96KN3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKNOX2Q96KN3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PKNOX2Q96KN3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKNOX2Q96KN3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PKNOX2Q96KN3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKNOX2Q96KN3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKNOX2Q96KN3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKNOX2Q96KN3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKNOX2Q96KN3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKNOX2Q96KN3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKNOX2Q96KN3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PKNOX2Q96KN3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PKNOX2Q96KN3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKNOX2Q96KN3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKNOX2Q96KN3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKNOX2Q96KN3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKNOX2Q96KN3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKNOX2Q96KN3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKNOX2Q96KN3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKNOX2Q96KN3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKNOX2Q96KN3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKNOX2Q96KN3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKNOX2Q96KN3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKNOX2Q96KN3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKNOX2Q96KN3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKNOX2Q96KN3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PKNOX2Q96KN3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PKNOX2Q96KN3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKNOX2Q96KN3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKNOX2Q96KN3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKNOX2Q96KN3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKNOX2Q96KN3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKNOX2Q96KN3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKNOX2Q96KN3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKNOX2Q96KN3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKNOX2Q96KN3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKNOX2Q96KN3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKNOX2Q96KN3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKNOX2Q96KN3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKNOX2Q96KN3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKNOX2Q96KN3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKNOX2Q96KN3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKNOX2Q96KN3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKNOX2Q96KN3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKNOX2Q96KN3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKNOX2Q96KN3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKNOX2Q96KN3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKNOX2Q96KN3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PKNOX2Q96KN3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKNOX2Q96KN3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PKNOX2Q96KN3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKNOX2Q96KN3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKNOX2Q96KN3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKNOX2Q96KN3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKNOX2Q96KN3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKNOX2Q96KN3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKNOX2Q96KN3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKNOX2Q96KN3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKNOX2Q96KN3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKNOX2Q96KN3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKNOX2Q96KN3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKNOX2Q96KN3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKNOX2Q96KN3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKNOX2Q96KN3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKNOX2Q96KN3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms