Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRIG1Q96JA1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRIG1Q96JA1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRIG1Q96JA1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRIG1Q96JA1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRIG1Q96JA1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRIG1Q96JA1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRIG1Q96JA1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRIG1Q96JA1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRIG1Q96JA1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRIG1Q96JA1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRIG1Q96JA1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRIG1Q96JA1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRIG1Q96JA1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRIG1Q96JA1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRIG1Q96JA1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRIG1Q96JA1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRIG1Q96JA1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRIG1Q96JA1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRIG1Q96JA1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRIG1Q96JA1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRIG1Q96JA1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRIG1Q96JA1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRIG1Q96JA1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRIG1Q96JA1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRIG1Q96JA1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRIG1Q96JA1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRIG1Q96JA1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIG1Q96JA1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIG1Q96JA1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIG1Q96JA1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIG1Q96JA1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRIG1Q96JA1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LRIG1Q96JA1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRIG1Q96JA1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRIG1Q96JA1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRIG1Q96JA1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRIG1Q96JA1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRIG1Q96JA1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRIG1Q96JA1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRIG1Q96JA1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRIG1Q96JA1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRIG1Q96JA1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRIG1Q96JA1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRIG1Q96JA1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRIG1Q96JA1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRIG1Q96JA1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRIG1Q96JA1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRIG1Q96JA1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRIG1Q96JA1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRIG1Q96JA1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRIG1Q96JA1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRIG1Q96JA1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRIG1Q96JA1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRIG1Q96JA1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRIG1Q96JA1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRIG1Q96JA1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRIG1Q96JA1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRIG1Q96JA1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRIG1Q96JA1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LRIG1Q96JA1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRIG1Q96JA1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRIG1Q96JA1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRIG1Q96JA1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRIG1Q96JA1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRIG1Q96JA1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRIG1Q96JA1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRIG1Q96JA1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRIG1Q96JA1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRIG1Q96JA1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRIG1Q96JA1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRIG1Q96JA1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRIG1Q96JA1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRIG1Q96JA1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRIG1Q96JA1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LRIG1Q96JA1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LRIG1Q96JA1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRIG1Q96JA1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRIG1Q96JA1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRIG1Q96JA1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIG1Q96JA1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRIG1Q96JA1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms