Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSIG2Q96IQ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSIG2Q96IQ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VSIG2Q96IQ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG2Q96IQ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSIG2Q96IQ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VSIG2Q96IQ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VSIG2Q96IQ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VSIG2Q96IQ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VSIG2Q96IQ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VSIG2Q96IQ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VSIG2Q96IQ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VSIG2Q96IQ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VSIG2Q96IQ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VSIG2Q96IQ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms