Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A3Q96HJ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A3Q96HJ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A3Q96HJ5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A3Q96HJ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A3Q96HJ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A3Q96HJ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A3Q96HJ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A3Q96HJ5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A3Q96HJ5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MS4A3Q96HJ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A3Q96HJ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A3Q96HJ5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A3Q96HJ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A3Q96HJ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A3Q96HJ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A3Q96HJ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A3Q96HJ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A3Q96HJ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A3Q96HJ5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A3Q96HJ5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A3Q96HJ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A3Q96HJ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A3Q96HJ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A3Q96HJ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A3Q96HJ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A3Q96HJ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A3Q96HJ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A3Q96HJ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MS4A3Q96HJ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A3Q96HJ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A3Q96HJ5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MS4A3Q96HJ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A3Q96HJ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A3Q96HJ5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A3Q96HJ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A3Q96HJ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A3Q96HJ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A3Q96HJ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A3Q96HJ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A3Q96HJ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A3Q96HJ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A3Q96HJ5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A3Q96HJ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A3Q96HJ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A3Q96HJ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A3Q96HJ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms