Protein–RNA interactions for Protein: Q96H78

SLC25A44, Solute carrier family 25 member 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A44Q96H78 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A44Q96H78 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A44Q96H78 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A44Q96H78 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A44Q96H78 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A44Q96H78 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A44Q96H78 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A44Q96H78 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A44Q96H78 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A44Q96H78 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A44Q96H78 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A44Q96H78 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A44Q96H78 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A44Q96H78 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A44Q96H78 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC25A44Q96H78 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A44Q96H78 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A44Q96H78 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC25A44Q96H78 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC25A44Q96H78 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC25A44Q96H78 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC25A44Q96H78 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A44Q96H78 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A44Q96H78 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A44Q96H78 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A44Q96H78 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A44Q96H78 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A44Q96H78 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A44Q96H78 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A44Q96H78 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A44Q96H78 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A44Q96H78 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A44Q96H78 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A44Q96H78 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A44Q96H78 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A44Q96H78 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A44Q96H78 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A44Q96H78 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC25A44Q96H78 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC25A44Q96H78 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC25A44Q96H78 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC25A44Q96H78 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC25A44Q96H78 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC25A44Q96H78 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC25A44Q96H78 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A44Q96H78 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A44Q96H78 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A44Q96H78 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC25A44Q96H78 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC25A44Q96H78 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC25A44Q96H78 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC25A44Q96H78 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A44Q96H78 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms