Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX27Q96GQ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX27Q96GQ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX27Q96GQ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX27Q96GQ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX27Q96GQ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX27Q96GQ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX27Q96GQ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX27Q96GQ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX27Q96GQ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX27Q96GQ7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX27Q96GQ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX27Q96GQ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX27Q96GQ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX27Q96GQ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX27Q96GQ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX27Q96GQ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX27Q96GQ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX27Q96GQ7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX27Q96GQ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX27Q96GQ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX27Q96GQ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX27Q96GQ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX27Q96GQ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX27Q96GQ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX27Q96GQ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX27Q96GQ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX27Q96GQ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX27Q96GQ7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX27Q96GQ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX27Q96GQ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX27Q96GQ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX27Q96GQ7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX27Q96GQ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX27Q96GQ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX27Q96GQ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX27Q96GQ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX27Q96GQ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX27Q96GQ7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX27Q96GQ7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX27Q96GQ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX27Q96GQ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX27Q96GQ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX27Q96GQ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX27Q96GQ7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX27Q96GQ7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX27Q96GQ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX27Q96GQ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX27Q96GQ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX27Q96GQ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX27Q96GQ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX27Q96GQ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX27Q96GQ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX27Q96GQ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX27Q96GQ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX27Q96GQ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX27Q96GQ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX27Q96GQ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX27Q96GQ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX27Q96GQ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX27Q96GQ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX27Q96GQ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX27Q96GQ7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX27Q96GQ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX27Q96GQ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX27Q96GQ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX27Q96GQ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX27Q96GQ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX27Q96GQ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX27Q96GQ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX27Q96GQ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX27Q96GQ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX27Q96GQ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX27Q96GQ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX27Q96GQ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX27Q96GQ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX27Q96GQ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX27Q96GQ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX27Q96GQ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX27Q96GQ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX27Q96GQ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX27Q96GQ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms