Protein–RNA interactions for Protein: Q96F24

NRBF2, Nuclear receptor-binding factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRBF2Q96F24 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRBF2Q96F24 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRBF2Q96F24 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRBF2Q96F24 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRBF2Q96F24 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRBF2Q96F24 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRBF2Q96F24 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRBF2Q96F24 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRBF2Q96F24 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRBF2Q96F24 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRBF2Q96F24 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRBF2Q96F24 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRBF2Q96F24 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NRBF2Q96F24 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRBF2Q96F24 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRBF2Q96F24 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRBF2Q96F24 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRBF2Q96F24 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRBF2Q96F24 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRBF2Q96F24 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRBF2Q96F24 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRBF2Q96F24 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRBF2Q96F24 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRBF2Q96F24 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRBF2Q96F24 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRBF2Q96F24 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRBF2Q96F24 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRBF2Q96F24 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRBF2Q96F24 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRBF2Q96F24 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRBF2Q96F24 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRBF2Q96F24 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRBF2Q96F24 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRBF2Q96F24 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRBF2Q96F24 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRBF2Q96F24 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRBF2Q96F24 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRBF2Q96F24 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRBF2Q96F24 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRBF2Q96F24 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRBF2Q96F24 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRBF2Q96F24 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRBF2Q96F24 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRBF2Q96F24 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRBF2Q96F24 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBF2Q96F24 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBF2Q96F24 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRBF2Q96F24 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRBF2Q96F24 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRBF2Q96F24 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBF2Q96F24 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBF2Q96F24 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBF2Q96F24 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRBF2Q96F24 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRBF2Q96F24 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRBF2Q96F24 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRBF2Q96F24 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRBF2Q96F24 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NRBF2Q96F24 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRBF2Q96F24 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRBF2Q96F24 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRBF2Q96F24 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRBF2Q96F24 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRBF2Q96F24 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRBF2Q96F24 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRBF2Q96F24 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRBF2Q96F24 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRBF2Q96F24 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRBF2Q96F24 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRBF2Q96F24 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRBF2Q96F24 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRBF2Q96F24 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRBF2Q96F24 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRBF2Q96F24 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRBF2Q96F24 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRBF2Q96F24 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRBF2Q96F24 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRBF2Q96F24 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRBF2Q96F24 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRBF2Q96F24 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRBF2Q96F24 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRBF2Q96F24 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRBF2Q96F24 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms