Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHFRQ96EP1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHFRQ96EP1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CHFRQ96EP1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHFRQ96EP1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHFRQ96EP1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHFRQ96EP1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHFRQ96EP1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHFRQ96EP1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHFRQ96EP1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHFRQ96EP1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHFRQ96EP1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHFRQ96EP1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHFRQ96EP1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CHFRQ96EP1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHFRQ96EP1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHFRQ96EP1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHFRQ96EP1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHFRQ96EP1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHFRQ96EP1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHFRQ96EP1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHFRQ96EP1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHFRQ96EP1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHFRQ96EP1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHFRQ96EP1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHFRQ96EP1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHFRQ96EP1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHFRQ96EP1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHFRQ96EP1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHFRQ96EP1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHFRQ96EP1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHFRQ96EP1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHFRQ96EP1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHFRQ96EP1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHFRQ96EP1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHFRQ96EP1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHFRQ96EP1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHFRQ96EP1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHFRQ96EP1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHFRQ96EP1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHFRQ96EP1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHFRQ96EP1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHFRQ96EP1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHFRQ96EP1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHFRQ96EP1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHFRQ96EP1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHFRQ96EP1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHFRQ96EP1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHFRQ96EP1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHFRQ96EP1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHFRQ96EP1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHFRQ96EP1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHFRQ96EP1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHFRQ96EP1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHFRQ96EP1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHFRQ96EP1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHFRQ96EP1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHFRQ96EP1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHFRQ96EP1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHFRQ96EP1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHFRQ96EP1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHFRQ96EP1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHFRQ96EP1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHFRQ96EP1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHFRQ96EP1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHFRQ96EP1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms