Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
L3HYPDHQ96EM0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
L3HYPDHQ96EM0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
L3HYPDHQ96EM0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
L3HYPDHQ96EM0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
L3HYPDHQ96EM0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
L3HYPDHQ96EM0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
L3HYPDHQ96EM0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
L3HYPDHQ96EM0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
L3HYPDHQ96EM0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
L3HYPDHQ96EM0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
L3HYPDHQ96EM0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
L3HYPDHQ96EM0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L3HYPDHQ96EM0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L3HYPDHQ96EM0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
L3HYPDHQ96EM0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L3HYPDHQ96EM0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
L3HYPDHQ96EM0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
L3HYPDHQ96EM0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L3HYPDHQ96EM0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
L3HYPDHQ96EM0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
L3HYPDHQ96EM0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
L3HYPDHQ96EM0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
L3HYPDHQ96EM0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
L3HYPDHQ96EM0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
L3HYPDHQ96EM0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
L3HYPDHQ96EM0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
L3HYPDHQ96EM0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
L3HYPDHQ96EM0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L3HYPDHQ96EM0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L3HYPDHQ96EM0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L3HYPDHQ96EM0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
L3HYPDHQ96EM0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
L3HYPDHQ96EM0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
L3HYPDHQ96EM0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
L3HYPDHQ96EM0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
L3HYPDHQ96EM0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
L3HYPDHQ96EM0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
L3HYPDHQ96EM0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
L3HYPDHQ96EM0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
L3HYPDHQ96EM0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
L3HYPDHQ96EM0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
L3HYPDHQ96EM0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
L3HYPDHQ96EM0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
L3HYPDHQ96EM0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L3HYPDHQ96EM0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
L3HYPDHQ96EM0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
L3HYPDHQ96EM0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
L3HYPDHQ96EM0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L3HYPDHQ96EM0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
L3HYPDHQ96EM0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
L3HYPDHQ96EM0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
L3HYPDHQ96EM0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms