Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDF1Q96CC6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDF1Q96CC6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHBDF1Q96CC6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDF1Q96CC6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDF1Q96CC6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDF1Q96CC6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHBDF1Q96CC6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHBDF1Q96CC6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDF1Q96CC6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDF1Q96CC6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHBDF1Q96CC6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHBDF1Q96CC6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDF1Q96CC6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHBDF1Q96CC6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHBDF1Q96CC6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDF1Q96CC6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHBDF1Q96CC6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHBDF1Q96CC6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHBDF1Q96CC6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHBDF1Q96CC6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHBDF1Q96CC6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHBDF1Q96CC6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHBDF1Q96CC6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDF1Q96CC6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHBDF1Q96CC6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDF1Q96CC6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDF1Q96CC6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDF1Q96CC6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHBDF1Q96CC6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHBDF1Q96CC6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHBDF1Q96CC6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHBDF1Q96CC6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHBDF1Q96CC6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHBDF1Q96CC6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHBDF1Q96CC6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHBDF1Q96CC6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHBDF1Q96CC6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RHBDF1Q96CC6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RHBDF1Q96CC6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDF1Q96CC6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDF1Q96CC6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHBDF1Q96CC6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RHBDF1Q96CC6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHBDF1Q96CC6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDF1Q96CC6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDF1Q96CC6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDF1Q96CC6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDF1Q96CC6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDF1Q96CC6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDF1Q96CC6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHBDF1Q96CC6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHBDF1Q96CC6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHBDF1Q96CC6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHBDF1Q96CC6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHBDF1Q96CC6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHBDF1Q96CC6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHBDF1Q96CC6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDF1Q96CC6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHBDF1Q96CC6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHBDF1Q96CC6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHBDF1Q96CC6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDF1Q96CC6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDF1Q96CC6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDF1Q96CC6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDF1Q96CC6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDF1Q96CC6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDF1Q96CC6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDF1Q96CC6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHBDF1Q96CC6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHBDF1Q96CC6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDF1Q96CC6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDF1Q96CC6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHBDF1Q96CC6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHBDF1Q96CC6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHBDF1Q96CC6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHBDF1Q96CC6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHBDF1Q96CC6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHBDF1Q96CC6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHBDF1Q96CC6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDF1Q96CC6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDF1Q96CC6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHBDF1Q96CC6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms