Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROPN1LQ96C74 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROPN1LQ96C74 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROPN1LQ96C74 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROPN1LQ96C74 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROPN1LQ96C74 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROPN1LQ96C74 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROPN1LQ96C74 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROPN1LQ96C74 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ROPN1LQ96C74 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ROPN1LQ96C74 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ROPN1LQ96C74 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ROPN1LQ96C74 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROPN1LQ96C74 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ROPN1LQ96C74 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROPN1LQ96C74 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ROPN1LQ96C74 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ROPN1LQ96C74 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ROPN1LQ96C74 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROPN1LQ96C74 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ROPN1LQ96C74 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROPN1LQ96C74 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROPN1LQ96C74 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROPN1LQ96C74 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROPN1LQ96C74 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROPN1LQ96C74 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROPN1LQ96C74 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ROPN1LQ96C74 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROPN1LQ96C74 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROPN1LQ96C74 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROPN1LQ96C74 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROPN1LQ96C74 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ROPN1LQ96C74 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROPN1LQ96C74 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROPN1LQ96C74 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ROPN1LQ96C74 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROPN1LQ96C74 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROPN1LQ96C74 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROPN1LQ96C74 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROPN1LQ96C74 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROPN1LQ96C74 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROPN1LQ96C74 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROPN1LQ96C74 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ROPN1LQ96C74 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ROPN1LQ96C74 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ROPN1LQ96C74 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROPN1LQ96C74 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROPN1LQ96C74 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ROPN1LQ96C74 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ROPN1LQ96C74 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ROPN1LQ96C74 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ROPN1LQ96C74 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ROPN1LQ96C74 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ROPN1LQ96C74 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ROPN1LQ96C74 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ROPN1LQ96C74 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ROPN1LQ96C74 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ROPN1LQ96C74 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ROPN1LQ96C74 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ROPN1LQ96C74 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ROPN1LQ96C74 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ROPN1LQ96C74 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ROPN1LQ96C74 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ROPN1LQ96C74 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ROPN1LQ96C74 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ROPN1LQ96C74 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ROPN1LQ96C74 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ROPN1LQ96C74 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ROPN1LQ96C74 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ROPN1LQ96C74 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ROPN1LQ96C74 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ROPN1LQ96C74 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ROPN1LQ96C74 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ROPN1LQ96C74 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ROPN1LQ96C74 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ROPN1LQ96C74 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ROPN1LQ96C74 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms