Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG2BQ96BY7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG2BQ96BY7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG2BQ96BY7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG2BQ96BY7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG2BQ96BY7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG2BQ96BY7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG2BQ96BY7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG2BQ96BY7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG2BQ96BY7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG2BQ96BY7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG2BQ96BY7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG2BQ96BY7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG2BQ96BY7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG2BQ96BY7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG2BQ96BY7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG2BQ96BY7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG2BQ96BY7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG2BQ96BY7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG2BQ96BY7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG2BQ96BY7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG2BQ96BY7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG2BQ96BY7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG2BQ96BY7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG2BQ96BY7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG2BQ96BY7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG2BQ96BY7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG2BQ96BY7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG2BQ96BY7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG2BQ96BY7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG2BQ96BY7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG2BQ96BY7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG2BQ96BY7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG2BQ96BY7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATG2BQ96BY7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG2BQ96BY7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG2BQ96BY7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG2BQ96BY7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG2BQ96BY7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG2BQ96BY7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG2BQ96BY7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG2BQ96BY7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG2BQ96BY7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG2BQ96BY7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATG2BQ96BY7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATG2BQ96BY7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG2BQ96BY7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATG2BQ96BY7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATG2BQ96BY7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG2BQ96BY7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG2BQ96BY7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG2BQ96BY7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG2BQ96BY7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG2BQ96BY7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG2BQ96BY7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATG2BQ96BY7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG2BQ96BY7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG2BQ96BY7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG2BQ96BY7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG2BQ96BY7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG2BQ96BY7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG2BQ96BY7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG2BQ96BY7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG2BQ96BY7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms