Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW9

TAMM41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAMM41Q96BW9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAMM41Q96BW9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAMM41Q96BW9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAMM41Q96BW9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAMM41Q96BW9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAMM41Q96BW9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAMM41Q96BW9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAMM41Q96BW9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAMM41Q96BW9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAMM41Q96BW9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAMM41Q96BW9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAMM41Q96BW9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAMM41Q96BW9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAMM41Q96BW9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAMM41Q96BW9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAMM41Q96BW9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAMM41Q96BW9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAMM41Q96BW9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAMM41Q96BW9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAMM41Q96BW9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAMM41Q96BW9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAMM41Q96BW9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAMM41Q96BW9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAMM41Q96BW9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAMM41Q96BW9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAMM41Q96BW9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAMM41Q96BW9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAMM41Q96BW9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAMM41Q96BW9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TAMM41Q96BW9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TAMM41Q96BW9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAMM41Q96BW9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAMM41Q96BW9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAMM41Q96BW9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAMM41Q96BW9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAMM41Q96BW9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAMM41Q96BW9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAMM41Q96BW9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAMM41Q96BW9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAMM41Q96BW9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAMM41Q96BW9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAMM41Q96BW9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAMM41Q96BW9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAMM41Q96BW9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAMM41Q96BW9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TAMM41Q96BW9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAMM41Q96BW9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAMM41Q96BW9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAMM41Q96BW9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAMM41Q96BW9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAMM41Q96BW9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAMM41Q96BW9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAMM41Q96BW9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAMM41Q96BW9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAMM41Q96BW9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAMM41Q96BW9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms